IQSS e-Satis#

Cette page concerne tous les IQSS e-Satis. Une page dédiée aux IQSS QualHas est disponible ici.

Les IQSS e-Satis ont une forme stable est sont recueillis tous les ans. Cela rend leur traitement beaucoup plus simple que les IQSS QualHas. La description des traitement est donc beaucoup plus simple.

Description générale#

Les IQSS e-Satis proviennent des questionnaires patients récoltés avec l’application e-Satis.

Cette dernière a été déployée sur trois périmètres d’activités de soins :

  • les hospitalisations de plus de 48 heures en Médecine/Chirurgie/Obstrétrique (à partir de 2016)

  • la chirurgie ambulatoire (à partir de 2018).

  • Les soins de suite et de réadaptation (à partir de 2021)

La BQSS compile les données issues des recueils annuels collectés sur ces deux périmètres.

Le schéma de données des IQSS e-Satis est décrit sur cette page ainsi que sur cette page pour la version clé-valeur.

Acquisition des données#

Les données e-Satis sont téléchargées depuis le portail data.gouv.fr, où elles sont regroupées par année (recueil 2016, recueil 2017, recueil 2018, recueil 2019, recueil 2020 ; les sources sont exhaustivement répertoriées dans le fichier resources/esatis/data_sources.yml). Les fichiers correspondants sont stockés par année au format CSV dans le dossier data/esatis/raw/.

Pour toutes demandes concernant spécifiquement ces données, s’adresser au producteur : Haute Autorité de Santé - service Évaluation et Outils pour la Qualité et la Sécurité des Soins (EvOQSS). Un formulaire de prise de contact est disponible sur la page correspondante du portail data.gouv.fr.

Traitements et agrégation des données#

Cette phase se décompose en 5 étapes :

  • nettoyage des données : 7 colonnes sont abandonnées car non pertinentes (participation, depot, rs_finess, rs_finess_geo, region, type, region_id) ; et normalisation des champs ayant des valeur mixtes (des valeurs numériques stockées sous forme d’entiers ou de chaînes de caractères). Les données résultantes sont stockées dans le dossier data/esatis/cleaned/

  • agrégation des données : cette étape fusionne tous les fichiers et dépose le fichier résultant esatis.parquet dans data/esatis/final

  • ajout du type du finess : grâce au fichier final des finess, une nouvelle colonne est ajoutée au fichier des IQSS e-Satis agrégé, correspondant au type du finess.

  • reformatage du fichier final :

    • le fichier est reformaté pour suivre le format clé-valeur. Ce fichier esatis_key_value.csv est stocké dans le dossier data/final.

    • On procède au report des valeurs manquantes sur toutes les variables concernées.

    • On rend les variables d’évolutions homogènes avec le reste de la base.

  • génération de métadonnées : génération d’un fichier CSV de métadonnées documentant les champs extraits (voir section correspondante ci-dessous).

Validation des données#

La validation des données des IQSS e-Satis est réalisée par la librairie frictionless et le standard Table Schema. Cette validation s’appuie sur deux fichiers de métadonnées au format JSON et se trouvant dans le dossier schemas/esatis : esatis.json et esatis_key_value.json.

Présentation du fichier CSV de métadonnées#

Le fichier CSV de métadonnées des IQSS e-Satis data/esatis/final/esatis_metadata.csv a été généré automatiquement grâce au fichier schemas/esatis/esatis.json décrivant le schéma de données au standard Table Schema. Il permet de documenter la version clé-valeur des données et contient 6 champs :

  • name : le nom de la variable

  • title : le titre de la variable, explicite la variable en une phrase

  • description : correspond à une description plus détaillée du champ

  • type : type primitif de la variable (chaîne de caractères, entier ou décimal)

  • secteur : correspond au secteur que cible l’enquête (par exemple MCO)

  • theme : correspond à la spécification de l’enquête au sein du secteur cible (pour la MCO, par exemple, hospitalisation de plus de 48h ou encore chirurgie ambulatoire)